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イルミナ NextSeq 550Dx システム
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IVD ハイスループットシーケンスプラットフォームを臨床研究ラボにご提供 クラス I 医療機器届出の次世代シーケンサー ・広がりつつある IVD アプリケーションに対応 クリニカルとリサーチの需要を支える柔軟性 ・幅広い基礎研究および臨床アプリケーションをサポートし、リード長の選択と複数のデータ出力の設定が可能 ターンアラウンドタイム(TAT)の短縮と操作性
の高いデータ解析 ・システム上またはクラウド上の高効率インフォマティクスにより、研究のスピードを加速し、 時間的制約のある臨床ニーズによるデータを迅速に生成可能 イルミナのサイエンティフィックサポート ・イルミナのサイエンスおよび専門知識に基づくIVD パートナーシップ 【特徴】 イルミナケミストリーが実現する高い精度 NextSeq 550Dx システムは、実績のある sequencing bysynthesis(SBS)ケミストリーを採用しており、 世界中のシーケンスデータの 90% が SBS ケミストリーを用いて生成されています。 この可逆的ターミネーター法により、伸長する DNA 鎖に取り込まれる一塩基が検出され、 膨大な数の DNA 断片の並列シーケンスを行うことができます。 イルミナの SBS ケミストリーは、4 つの標識ヌクレオチドすべての自然法則を利用しており、結合バイアスを抑え、 反復配列やホモポリマーを高い精度でシーケンシングできます。 3ステップのシンプルなワークフロー アッセイは、ライブラリー調製、シーケンス、およびデータ解析のシンプルな 3 つのステップからなります。 ・ライブラリー調製:(例:True Seq Custom Amplicon の場合) ライブラリー調製では、プライマーをゲノム DNA(gDNA)サンプルに添加することに始まり、 何百ものターゲット領域の同時キャプチャーおよび増幅のためにインデックス付きライブラリーを作製します。 gDNA または適格性評価されたホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織から抽出した DNA を用いて、 高品質のシーケンスライブラリーを 2 日未満で調製することができます。 ・NextSeq 550Dx システムによるシーケンス: NextSeq 550Dx システムでのラン実行はあらかじめ試薬カートリッジを用いることで簡単に行うことができ、 融解、ロード、および実行までの総操作時間はおよそ 30 分間です。 直観的なユーザーインターフェースにより、研究者はユーザートレーニング、装置セットアップに時間を奪われず、 種々のシーケンスアプリケーションを実行することができます。 さらに、NextSeq550Dx システムはクラスター形成および SBS シーケンスを同一装置上で行うことが可能で、 データ解析も装置上またはクラウドで行うことができます。 ・統合されたシステムソフトウェア: NextSeq 550Dx システムでは、機器に搭載されたオンボード解析ソフトウェアが利用でき、 現在と将来のアッセイをサポートするモジュールソフトウェアアーキテクチャが採用されています。 装置コントロールソフトウェアへは、使いやすいタッチスクリーンのインターフェースからアクセスします。 Local Run Managerソフトウェアはシーケンスランの計画立案、監査証跡によるライブラリーとランの追跡、 および装置上のデータ解析モジュールとの統合をサポートします。 Local Run Manager は装置のコンピューター上で稼働しますが、ランの進捗状況の監視や解析結果の閲覧は 同一ネットワーク内に接続されたコンピューターからでも行うことができます。 シーケンスランが終了すると、Local Run Manager は自動的にアプリケーション別の解析モジュールのうちの 1 つを用いて、 データ解析を始めます。 利用可能なクリニカルアプリケーション 診断(Dx)モードの NextSeq 550Dx システムは現在、以下に示すアプリケーションをサポートしています。 ・体細胞バリアントコール: FFPE サンプル由来の gDNA からのライブラリー調製により、体細胞バリアントコールワークフローは、 検出限界 0.05 で体細胞バリアントコールのための定性的な結果をもたらします。 体細胞バリアントコールワークフローは 4 ~ 48 までのマルチプレックスサンプルを NextSeq 550Dx システム上で サポートします。 ・生殖細胞バリアントコール: 末梢全血 gDNA からのライブラリー調製により、生殖細胞バリアントコールのワークフローは、 ホモ接合またはヘテロ接合の生殖細胞バリアントコールのための定性的な結果をもたらします。生殖細胞バリアントコール ワークフローは 8 ~ 96 までの複数のサンプルを NextSeq 550Dx システム上でサポートします。 【仕様】 パラメーター 規格 システムの構成 RFIDトラッキング機能付きの試薬消耗品 システム制御 コンピューター プロセッサー:Dual Intel Xeon E5-2648L v3 1.8 GHz CPU メモリー:128 GB ハードドライブ、診断(Dx)モード:2 × 2 TB(RAID 1) ハードドライブ、研究(RUO)モード:2 × 2 TB(RAID 1) オペレーティングシステム:Windows 10 動作環境 温度:19℃から 25℃(22℃± 3℃) 湿度:20% ~ 80%、結露なきこと 高度:0 ~ 2000 m(6500 フィート) 換気:最大 2048 BTU/hr @ 600 W ※室内使用に限る 発光ダイオード(LED) 520 nm、650 nm レーザーダイオード 780 nm、 クラス IIIb 寸法 幅 × 奥行 × 高さ:54 cm × 69 cm × 58.5 cm 重量:84 kg 木枠込みの重量:163 kg 所要電源 100-120 VAC 15 A 220-240 VAC 10 A 無線自動識別装置(RFID) 周波数:13.56 MHz 電源:供給電流 120 mA、RF 出力 200 mW 製品安全性、 コンプライアンス NRTL 認証 IEC 61010-1 CE マーク認証 FCC/IC 承認済み 製造販売届出番号:13B1X10303000001